Biopolymer Chain Elasticity (BCE)
L'approche de modélisation nommée Biopolymer Chain Elasticity (BCE) considère la chaîne sucre-phosphate du simple-brin d'ADN ou d'ARN comme un élément global de la structuration des boucles, à la différence des autres approches qui mettent seulement l'accent sur les interactions entre bases. Elle s'appuie sur la théorie de l'élasticité pour manipuler les chaînes simple-brin d'acides nucléiques comme des barres minces. Lorsque la barre est déformée, la chaîne d'acides nucléiques qui lui est ''attachée'' suit la déformation globale. Dans le cadre de cette théorie, un jeu d'orientations aux extrémités de la barre (directions imposées aux limites) et la longueur de la barre suffisent à calculer la trajectoire de déformation minimale, et par extension la structure de la boucle. |
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